Hola @DarkGhost, buenas noches 
Disculpe la tardanza, entre que he tenido que hacer unas cosas y probar las páginas de marras no he podido antes.
De paso aprovecho para decirle que he probado mas o menos a fondo las páginas y, de momento, sigue mas fluido, no se que pasará mas adelante pero ahora va un poco mejor. Creo que voy a desinstalar la extensión de Malwarebytes, de todas formas con uBlock y la ayuda de ViruTotal creo que voy a estar protegido
1ero.- Voy a empezar por lo que mas liado me tiene…
Vamos a ver… porque creo que lo que usted me ha dicho en su respuesta me ha encendido la bombilla. Me refiero a esto…
Primero… esto es una cosa que caí ayer…. Supongamos una aplicación en la que se confíe que no va a pasar nada hoy, ni de ransomware, ni de nada, le doy el permiso, con lo cual esa aplicación se queda ya para siempre con el permiso dado, pero ahora resulta que dentro de X días (o meses) una vulnerabilidad, virus, ransomware… o cualquier “bichejo” se aprovecha de esa aplicación para colarse… entonces cada vez que permitamos una aplicación corremos, en menor o mayor medida, el riesgo de que se infecte el equipo ¿no?..
Vamos a ver… porque a lo mejor es que yo lo veo mas lioso de lo que es en realidad…
Todo lo que se bloquea aparece por lo visto en la ventana de Aplicaciones bloqueadas reciéntemente, absolutamente todo, entonces… lo que yo veo mas sencillo y de menos lio es ir directamente a esa ventana y clicar en el signo “mas” de la aplicación en cuestión… ¿esto se puede hacer así siempre?.. ¿sin tantear en otro sitio?...
En el caso de que se pueda hacer así (lo veo mas facil), ya no me cuadra el caso de Firefox y el de Glary, porque en estos 2 casos lo se porque usted me ha dicho lo que tengo que hacer, pero en otra ocasión con otro programa u otro portable hago lo mismo y no es así. Me explico…
En el caso de Firefox, usted me dijo que le permitiera el acceso a las dos aplicaciones, a la aplicación que me marca Windows Defender y al ejecutable general de Firefox. Si yo no le pregunto nada, yo le accedo el permiso SOLO a la aplicación que se bloquea… o a lo mejor, y por desconocimiento del S.Operativo y/o antivirus, SOLO al ejecutable general del portable de Firefox. Entonces, yo le voy a dar el acceso a las dos aplicaciones, pero si le doy solo a la que me sale como bloqueada no pasa nada tampoco ¿no?.. si dentro de X tiempo me pide la del ejecutable general pues a través de la opción Examinar incluyo Firefox (clicando en el icono de firefox que sale justo al abrir la carpeta del portable).
En el caso de Glary, que también aparecen 2 aplicaciones le accedería el permiso según me apareciera, aunque ahora le de acceso a las dos por habérmelo usted dicho.
HDSentinel.exe → Es del portable de HardDisk, si usted lo dice se lo doy pero lo considero innecesario ya que pienso desinstalar el portable, ya no lo necesito para nada ¿no?.
¿A las otras dos le puedo dar acceso?..
SrTasks.exe → Parece ser que realiza las acciones en segundo plano, o algo así. En google dice que es un proceso de Microsoft, no se…
SystemPropertiesProtecction.exe → Ni idea de lo que es. Lo he buscado en explorador de archivos y no aparece… o yo no lo encuentro
Vea las siguientes imágenes sobre esto… De momento me queda así a la espera de lo que usted me diga.
(Fíjese que de momento solo he incluido de Firefox la que me pide, la del portable general no)
Nota: En definitiva me quedaría por darle acceso al ejecutable general del portable de Firefox y a las que usted ve en las imágenes
2ndo - Video DownloadHelper
Pues le explico lo mas resumido posible…
En W7 utilizaba FVD Video Download, la mejor que había para descargar de TODOS sitios de internet, y un tiempo, aunque poco, tambíen utilicé Video DownloadHelper, también muy buena pero para mi peor que la anterior. Resulta que desde el paso a webextension de las extensiones, eliminaron las nativas y seguían en la tienda de Firefox con otros “autores” (para que nos entendamos). En el caso de FVD Video Download no la recomiendan porque parece ser que es maliciosa y en el caso de Video DownloadHelper había que instalar una especie de aplicación para que te descargara de supuéstamente todos sitios. Digo supuéstamente, porque a mi me fallaba mucho, me dejaba el video a medias, si era una película descargaba como si fuera el trailer, un día funcionaba y otro no, en fin… un desastre, hasta que decidí desinstalarla.
Si quiere mas información sobre esto puede echarle un vistazo a una incidencia (Extensión de Firefox para descargar videos de cualquier página de internet (no solo de YouTube)) que abrí en el foro este verano.
Probé el “ciento y la madre”… creo yo que casi todas las que aparecían en aquel momento en la tienda de Firefox y ninguna iba fina, hasta que di con SaveFrom, que aunque solo descarga de 3-4 sitios al menos no me falla, toco madera 
3ero - Descriptores de seguridad, chkdsk, etc…
Ok…. entonces tranquilidad absoluta.
Una cosa amigo… todavía no he vuelto a realizar limpieza con Glary, esta noche la haré y le marcaré la casilla de Reparador de disco. Si da errores ¿lo ignoro y me fio mas de lo que dijo el informe de chkdsk?..
Eso de los Descriptores de seguridad ¿qué es?.. ¿es un problema grave quizás?..
Bueno amigo, buen “finde”… 