Hola, buenas @1Matute
OK 
, perfecto.
La reparación del sistema ha ido correctamente y esto es una muy buena noticia.
Como en tu caso es un disco duro mecánico HDD, este sí que debe de ser desfragmentado. Para ello haz lo que se indica en esta guía: ¿Como Desfragmentar el/los Discos y Particiones?
Me comentas como ha ido esa desfragmentación y ya casi estaríamos.
Salu2.