Perfecto. 
Ahora vas a tener que comprobar cómo tienes configurada la BIOS de tu máquina, para que pueda realmente arrancar desde esa unidad USB y puedas proceder a realizar la instalación del nuevo windows.
Te dejo por aqui un video donde se explican los pasos necesarios para que lo puedas conseguir 
https://youtu.be/IeaV9bpLGl0
Cuando YA hayas podido dejar esos valores de la BIOS adecuadamente y con el USB conectado debería iniciarse el instalador de Windows 10 y cuando llegues a esta opción :
Seleccionas la opción de Personalizada… e inmediatamente deberá aparecerte otra similar a esta donde deberás ver el disco duro que tuvieras con una serie de trozos/particiones :
Dinos que ves exactamente e intenta ponernos una imagen/foto de ella.
Cualquier duda consultanos.
Saludos.