Hola.
A que otras amenazas te refieres…??
Al tener instalada la version de prueba de Malwarebytes, y por un tiempo gratuito de 14dias tendrás activada la protección total del producto y éste te realizara exámenes periódicos y sin necesidad de tu intervención durante ese tiempo. 
Por nosotros no hay problema, puedes hacer un nuevo Análisis perfectamente.
Pero… aprovecha para hacer un ANÁLISIS TOTAL y conecta a tu equipo cualquier disco externo que puedas tener o unidades USB… tarjetas de memoria, etc… para que se revisen completamente y al terminar nos pones el nuevo informe.
Para hacerlo usa el “Análisis personalizado” y seleccionas TODAS las unidades que existan en tu equipo 
Análisis personalizado., dejando las demas opciones como esten.
Saludos.