Hola. Intente borralo desde el modo seguro y se crean todas las carpetas de nuevo. Intente formatear siguiendo los pasos desde Cmd y en el paso: create partiton primary, me sale este mensaje: mensaje disk part pendrive.txt (608 Bytes) No obstante igualmente consegui formatearlo pero siguen apareciendo las carpetas y archivos. Tambien puse el lapiz en un portatil completamente nuevo y limpio y pobe a borrar desde alli y lo mismo. Ese portatil no ha estado en contacto ni con los otros ordenadores ni con el lapiz anteriormente. Saludos.
Hola y con permiso. 
Solo entro para haceros un comentario. 
Es muy probable que ese USB este dañado, 
yo tengo todavía guardado(por NO tirarlo y desde hace años) un USB con ese mismo problema. 
Las memorias USB son elementos muy delicados, cualquier pequeña caida/golpe o incluso por mala calidad del producto pueden provocar que se deterioren con facilidad.
Y una vez dañados, por mucho que queramos eliminar/borrar o formatearlos seguiremos viendo que el contenido del USB sigue siendo el mismo.
Incluso podemos intentar eliminar/formatear el USB desde un entorno distinto a Windows como puede ser un LiveCD y el resultado será el mismo.
Puedes probar a usar un LiveCD como este que te pongo para desde el eliminar los archivos y verificar SI una vez eliminados y despues de desconectar el USB y volverlo a a conectar siguen apareciendo. 
¿Cómo puedo salvar mis archivos si en mi PC NO arranca el sistema? o ¿Cómo hacer un Livecd.?
Sigan ustedes y FELICES FIESTAS. 
Saludos.
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Gracias Javier voy a probar, pero el enlace que me pusiste de Livecd esta caido. Felices fiestas y saludos.
Hola @JAL2000
Revisa de nuevo pinchando en el enlace, porque acabo de probarlo y me ha funcionado, 
puede que fuese un problema puntual. 
Dinos si has podido acceder de nuevo. 
De todas maneras, un comentario, en este manual basicamente se explica como crear un LiveCD y luego usarlo para poder salvar los archivos del disco duro de un equipo que NO arranca o NO deja acceder al contenido del mismo.
En TU caso el uso NO sería para lo mismo, pero el uso del LiveCD, bien sea con este o cualquier otro que tu prefieras, te puede permitir valorar SI el problema es por una infección o por un problema físico de daño del USB.
Saludos.
Pues clico donde pone aqui: :1: Nos descargamos una .iso desde Aquí Y me manda a una pagina quw pone 404: Page not found Saludos y gracias por tu ayuda.
Ahhhh… entendido, 
pensé que te referias al tema principal nuestro y era el enlace a la descarga de Ubuntu.
Ya la tienes modificada, que la habían cambiado.
Saludos.
Buenos dias solo quiero aportar que me paso lo mismo intentaba formatear , lo eliminaba y mis archivos seguian ahi , intente con el cmd tampoco intente desde linux y nada , le pase antivirus todos lo que hay en el mercado y nada , ningun antivirus detecta bicho , tambien pense que el usb que lo habia prestado le habian puesto en modo lectura entre al cmd y lo desactive e intente formatear y nada seguia igual yo creo en lo personal que ese debe ser algun problema del pendrive en mi casa ya bote el usb jijij espero que les ayude
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Efectivamente… USB para tirarlo a la basura. 
Saludos.
Hola, gracias a todos por la ayuda, finalmente doy por hecho que el pen esta dañado. Por lo que creo que ya se puede cerrar este hilo. Una vez mas gracias y feliz año nuevo. Saludos. Jordi