Pc tarda en apagarse desde que instale Malwarebytes

Recuerda desinstalar primero la anterior versión y una vez instalada la nueva versión karpesky free realizar las siguientes exclusiones como se ve en la imagen de esta respuesta en ambos programas.

Para poder ver esas carpetas debes antes mostrar los archivos ocultos en Windows como se indica en el siguiente Manual:

Ver archivos ocultos en todos los Windows

En Kaspersky debes dirigirte a configuración - adicional- amenazas y exclusiones - administrar exclusiones

Una vez realizadas las exclusiones en ambos productos compruebas cómo va el problema planteado