Entra al manual de Malwarebytes Anti-Malware, y realizaras un “Análisis Personalizado”, marcaras todas las casillas (incluyendo la de rootkits) y todas las unidades que te aparezcan. Me pegaras el reporte también, y desactiva tu antivirus al realizar nuevamente.
No canceles el análisis, déjalo que termine puede llegar a mas de 7-10hs dependiendo de la capacidad de tu disco y la cantidad de archivos que tengas, si tarda mucho mas, nos comentas mientras siga el análisis en progreso, y veremos que hacer.