Pues en principio si el equipo se volvió a infectar eso significa que probablemente tras conectar a la Red local de la empresa, la cual aún seguía infectada, se volvió a conectar. Debes realizar el procedimiento descrito poca cada equipo totalmente desconectada de la red. Y yo dejaría ese equipo un dia más desconectada de la red probando reinicios para confirmar que no se reinfecta.
Este trojano Emotet es una infección bastante grave y puede comprometer de forma seria las computadoras de una red.
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