Por el contrario esas infecciones si afectan a todo el sistema.
Vamos a seguir buscando 
Realiza los pasos que te pongo a continuación, sin cambiar el orden y síguelos al pie de la letra:
Conectas todos tus dispositivos externos (todos los discos duros externos que tengas, USB, etc).
1) Descarga Eset Online Scaner Manual de Uso y realizas un análisis del PC, lee detalladamente las instrucciones y realizas un Análisis Personalizado tal y como se indica en su manual. Me traes su reporte.
2) Realizas un análisis con **Dr Web CureIt **siguiendo las instrucciones de su manual perfectamente explicadas. Eso sí, descarga Dr web Cure It de: https://www.infospyware.com/Software/click.php?id=41
Nota: Presta atencion una ves que eset termina su analisis para poder generar bien el reporte, si por alguna razon se te pasa puedes subir una captura de pantalla con los archivos que puso en cuarentena.
Pegas los reportes de Eset Online Scaner y Dr Web CureIt y comentas como va el PC.
Salu2.