Hola @uri81
Vamos a realizar unos análisis mas, ya que las infecciones que tenias, generalmente se ocultan y son difíciles de eliminar. Una ves que términos de desinfectar tu maquina te indicare los pasos correspondientes para tratar de recuperar tus archivos.
Descarga Malwarebytes-AntiRootkits sigues las instrucciones de su manual y me traes sus correspondientes Informes de análisis: Mbar-log.txt y System-log.txt tal como se indica en su manual (Actualizando la Database).
Descarga, instala y ejecuta TDSKiller . Marca todas las casillas (Loaded Modules, Verify file digital signatures y Detect TDLFS file system). Sí te pide reiniciar lo haces, ejecutas de nuevo la herramienta y al marcar nuevamente las casillas que te he dicho, ya te dejara analizar.
Traes los reportes y nos comentas como va todo
Saludos